南通市通州区人民医院始建于1950年8月，是通州医疗、医学教学、医学科研和预防保健的中心，南通大学医学院、南京医科大学教学医院，国家级"爱婴医院"，上海市第一人民医院集团通州分院。2016年1月晋升为三级医院。
医院承担着通州和周边地区120多万人口的医疗保健任务。2016年收治门急诊病人58万人次，收治住院病人5.3万人次，业务收入8.6亿元。现有在岗人员1120人，其中高级职称166人、中级职称460人，博士、硕士研究生86人。14人次被南通市确定为"226"高层次人才，32人次被评为南通市、通州区中青年专业技术拔尖人才，4人次荣获通州区"优秀专业技术人才成就奖"和"科技功臣"奖，7人受聘为南通市医学会专业分会副主任委员。
医院拥有固定资产5.8亿元，占地面积4万平方米，建筑面积10.7万平方米。编制床位900张，开放床位1350张，设有46个临床医技科室、30个病区，"120"急救中心提供24小时服务。
建筑面积36000平方米的门急诊医技楼及肿瘤中心于2010年4月投入使用，功能完善，流程科学；建筑面积37130平方米的22层病房大楼于2013年8月投入使用，与建筑面积19100平方米的16层病房大楼联为一体，层层相通，为广大病员提供了轻松便捷，温馨舒适的就医环境。
医院全力实施"名院、名科、名医"三名工程，积极开展新技术、新项目。脑血管介入技术、心脏介入技术、腹腔镜微创手术、关节镜等多项微创技术在南通地区处于领先水平；无痛胃镜、肠镜、纤支镜的检查及治疗技术体现了医学的人文关怀。医院拥有直线加速器、磁共振、128层CT、大C臂、彩色多普勒、DR、数字胃肠机、高压氧舱、全自动生化分析仪、全自动酶免仪、微生物鉴定药敏测试系统、化学发光分析仪等性能优良的仪器设备，建立了较完善的医院信息管理系统，在南通地区率先引进自动发药系统和静脉输液配置中心。近三年来，全院共开展科研31项，开展新技术、新项目75项，发表学术论文240篇，其中SCI期刊论文4篇，中华系列及科技统计源期刊64篇。骨科、神经内科、神经外科、泌尿外科、麻醉科、重症医学科、耳鼻咽喉科、眼科、肿瘤科、消化内科、检验科等11个科室为南通市重点专科；呼吸内科、心血管内科、放射科等3个科室为南通市重点建设专科；血液内科、康复医学科等2个科室为南通市临床特色专科。
医院广泛开展对外合作，柔性引进医学人才。成立了上海市第一人民医院医疗集团消化疾病、心脏疾病、创伤、肿瘤、眼科、耳鼻咽喉-头颈外科等6个临床诊治分中心。与江苏省人民医院合作，成立"江苏省人民医院冠心病中心南通市通州区人民医院分中心、江苏省危急重症远程诊治网络医院"。与上海复旦大学附属中山医院签订区域医疗协作体战略合作框架协议，实现医疗优质资源共享、医疗技术交流、医学人才培养、提升诊治水平和优化患者服务。与南通大学合作，成立了南通大学脑血管疾病研究所和脑血管疾病诊治中心。
医院连续多年被南通市委、市政府命名为"文明单位"。
