安徽省儿童医院筹建于1982年，1990年开诊,历任领导班子率领全院职工本着“仁爱、厚德、和谐、创新”的治院精神，励精图治，大胆创新，现已成为全省唯一一所设备先进、学科门类齐全，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级大型综合性三级甲等儿童专科医院。医院现为安徽省儿童医疗协会会长单位、安徽省儿科专业质控中心主任单位、安徽省新生儿急救中心和随访干预中心、安徽省儿童急救中心、北京儿童医院集团首家成员单位；是安徽省儿科医学研究所挂靠单位、安徽医科大学附属省儿童医院、国家级儿科住院医师规范化培训基地、国家级新生儿围产期医学专业专科医师培训基地；还是全省儿科重症监护专科护士培训基地、全省妇幼医护培训基地、新生儿内科培训基地、省手术室专科护士临床实践基地、省骨科专科护士临床实践基地、省肿瘤专科护士临床实践基地等。
医院占地面积5万平方米，拥有医疗用房面积7.2万平方米，开放床位1237张，设33个临床科室、6个医技科室、6个临床专科。2018年门诊量106.7万人次，年出院病人6.9万人次，年住院手术近1.9万台次。全院现有职工1846人,中级以上职称572人，其中高级职称139人。医院拥有全国一流带环境体验的1.5T核磁共振、64排螺旋CT等现代化的医疗、科研设备。
医院学科门类齐全，儿内科系统设有新生儿内科、呼吸内科、消化内科、肾内科、血液内科、神经内科、风湿免疫科、感染科、心血管内科等，急救中心设有急诊内科、急诊外科、院前急救转运、急诊综合病房、PICU等，儿外科系统设有普外科、心脏外科、胸外科、神经外科、新生儿外科、泌尿外科、骨科、烧伤整形科、大五官科等。“十二五”期间，新生儿科为省优先发展临床重点专科、小儿心胸外科为省临床重点专科，小儿骨科、康复医学科（儿童）为省临床重点培育专科；“十三五”期间，小儿骨科为省临床重点专科，PICU和神经内科为省重点培育专科。近年来，医院大力实施科教兴院战略，鼓励开展新项目，支持临床科研，在危重新生儿的抢救、小儿先天性食道闭锁等先天性畸形、小儿脑瘫、癫痫、哮喘、肾病、先天性骨关节畸形、小儿先心病以及儿童白血病、恶性肿瘤诊治方面有丰富经验。
在医院自身快速发展的同时，为迅速改变我省目前儿童医疗资源严重不足、儿科医师紧缺的现状，充分发挥省儿童医院在全省儿科的龙头带动作用，由我院牵头在全国率先成立了首家儿童医疗协会，成立安徽省儿童急救中心，开通安徽省儿童“120”，牵头成立安徽省首个医联体---安徽省儿童医疗联合体，建设安徽省儿童医学远程会诊中心，以省儿童医院为龙头、地市县医院儿科为枢纽、乡镇村为网底五级联动的儿童医疗急诊急救的医疗服务体系，让全省患儿在“家门口”就能享受到省城大专家乃至北京儿童医院等全国顶尖儿童医院专家的优质诊疗服务，牵头成立安徽省儿科专业质量控制中心。每年为全省培训基层儿科医生和妇幼保健系统的儿童保健人员2000多人次，迅速提升了基层的儿科诊疗水平，为降低我省婴幼儿死亡率作出了重大贡献。
医院先后获得“全国卫生系统先进集体”“全国巾帼文明示范岗”“省直文明单位”“全国院务公开先进单位”“安徽省诚信医院”“合肥市消防安全能力建设4A级单位”“全国创先争优先进集体”“全国卫生计生系统先进集体”等各种荣誉称号。在“安徽省十大服务行业居民满意度调查”中，2014-2018年连续五年获得“金口碑奖”。
新时代，新机遇，我院将以服务全省儿童健康事业为己任，加快科技兴院的步伐，努力提高医院的整体实力，把医院建设成为学科门类齐全、诊疗手段先进的国内一流的儿童医院。
