仙居县中医院成立于1988年，是一所集医疗、保健、康复、教学、科研为一体的二级甲等中医医院，省级平安医院，仙居县惠民医院、仙居县中医学会、中西医结合学会挂靠单位、台州市社保、仙居县农医保定点单位；国家传染病防治示范区——乙肝诊治定点医院和远程会诊中心。医院占地面积6670平方米，总房屋建筑面积11029平方米，核定床位数 250张，实际开放床位232张。医院现有职工274名，其中高级职称25名，中级职称68名。
医院科室配备齐全，医院开设有外科、内科、肝病肿瘤科、妇产五官科、骨伤科、康复针灸推拿科六个病区。门急诊开设有急诊科、外科、内科、骨伤科、康复科、针灸推拿科、中医脾胃科、风湿科、肝病科、中医妇科、妇产科、小儿科、呼吸科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、心理门诊、疼痛门诊、肠道门诊、发热门诊等20多个专科专病门诊；医技科室配备有药剂科（中、西药房、煎药房）、检验科、B超、放射科、心电图（动态心电图、动态血压）、病理科、胃镜室、特检科、消毒供应中心等科室，还开设了健康体检中心。
医院配备有先进的德国西门子螺旋CT、奥林巴斯NBI高清电子胃镜、数字化X线摄影系统（DR）、全自动生化仪、腹腔镜、多台彩色多普勒B超（彩超）、LEEP刀、麻醉机、24小时动态心电图和动态血压分析仪、肺功能仪、动脉硬化检测仪、骨密度仪、射频消融治疗仪；还配备有骨质疏松治疗仪、中药熏蒸器、热疗仪、信息红外线肝病治疗仪等中医特色诊疗仪器。
医院一直坚持以中医为特色、中西医并重的学科发展道理，各学科根据群众医疗需求，结合学科特色，依托先进的诊疗仪器，开展特色、优质诊疗服务，取得了显著成效。医院目前拥有市级重点学科1个（为我县唯一一个重点学科），县级重点学科3个，县级重点扶持科室2个。开展了肝脏穿刺活检术、腹腔灌洗术、肾癌根治术、前列腺电切术、内镜下食道支架置入术、食道、吻合口良恶性狭窄的多种方法扩张术、EMS(胃粘膜息肉摘除术)、ESD(胃食道粘膜肿瘤切除术)、射频微创介入术治疗颈、腰椎间盘突出症、外科、妇科微创手术、超声引导下肝脏穿刺活检术及超声引导下肝肾囊肿治疗术等手术。擅长中医及中西医结合治疗常见病、多发病及疑难病症，开展了“冬病夏治”、“中医膏方节”、“小针刀”、“中医体质辨识”等中医特色诊疗项目。在脾胃病、中医肿瘤、中风、腰椎间盘突出症、颈椎病、中医妇科等疾病的中西医结合治疗在当地及周边地区均有较高声誉。
医院坚持“科技强院、人才立院、质量荣院、中医兴院”的发展战略，实践“精诚厚德、严谨求实”的院训，不断完善医院管理体系、加强特色学科建设、提升医院文化内涵，进一步完善医院综合服务能力，为群众提供优质的医疗服务。
