鄂尔多斯市中医医院1979年获批复、1982年建立，是一所集中医医疗、预防、康复、保健为一体的综合性三级甲等中医医院。
医院占地2.7万平方米，建筑总面积5.4万平方米，现使用面积为4万平方米，编制床位480张，目前，开方床位400张，年门急诊人次33万人次。现有在职职工517人，卫生专业技术人员453人，中医药人员112人，护理人员164人，其中高级职称人员86人，中级职称人员96人，具有硕士学历的38人，自治区名中医2人，鄂尔多斯市名中医13人，鄂尔多斯市名老中医1人。开设了针灸科、骨伤科、妇产科、儿科、肾病科、心血管病科、肺病科、脾胃病科、脑病科等26个一级临床科室；13个行政职能科室，15个护理单元，11个医技科室；自治区中医特色优势重点专科3个（针灸科、妇产科、肾病科），自治区中医特色优势重点专科在建设项目3个（脾胃病科、脑病科、骨伤科），市级重点专科7个（肿瘤科、皮肤科、肺病科、心血管病科、内分泌病科、儿科、肛肠科）。目前医院已经与北京中医药大学、望京医院、东方医院在人才培养、科研等项目建立了合作关系，同陕西省中医医院结成医联体，逐步形成了“大综合、强专科、多特色”的优势格局。
医院设备齐全，医疗设备总值近1.3亿，拥有飞利浦64排128层CT、美国GE双排螺旋CT、德国西门子1.5T核磁共振、德国西门子医用血管造影X射线机（DSA）、美国GT和德国西门子DR等设备 。
医院把发展作为第一要务，以发展特色优势学科为核心，立足把服务市场做大，把临床学科做强，把医疗技术做精，狠抓各项措施的落实。以公立医院改革为契机，坚持公立医院公益性，要将问题导向，患者需求导向，医院发展导向有机统一，整体推进，实行一个灵魂（“大医精诚”的医院精神）、三个支撑（创新、人才、品牌树院为支撑）、五个抓手（患者的需求、“三甲”医院的创建、中西医并重、医养结合、加强宣传）、一个核心（加强党的领导）的“1351”医院发展规划，扩大中医影响力，为加快中医药发展，提升中医药服务能力，以实现人民群众可承受，政府可承担，医院可持续发展，老百姓满意为目标。
